Zamrażarkę niskotemperaturową należy rozmrażać minimum 1 raz w roku. Jest to szczególnie ważne dla prawidłowego wskazania czujników temperaturowych, które w miarę zwiększenia oblodzenia przekazują nieprawidłowe wartości. Rozmrażanie zamrażarek niskotemperaturowych najlepiej jest przeprowadzać po okresie letnim, kiedy wilgotność powietrza jest bardzo wysoka, co w znacznym stopniu przyczynia się do odkładania lodu wewnątrz komory zamrażarki. Należy pamiętać, aby zaplanować rozmrażanie zamrażarki wcześniej przenosząc zamrożony materiał do innego urządzenia. Procedura rozmrażania zamrażarki niskotemperaturowej polega na jej odłączeniu od źródła zasilania, pozostawieniu otwartych drzwi zewnętrznych i wewnętrznych. Przed procesem rozmrażania zamrażarki warto pamiętać o zakręceniu butli z CO2 (jeżeli zamrażarka jest wyposażona w system CO2 backup), wyłączeniu zasilania bateryjnego, które podtrzymuje pracę wyświetlacza zamrażarki oraz systemu alarmowego oraz o rozłożeniu ręczników pod urządzeniem, w które będzie wsiąkać woda.
